院系部分

党群组织
- 党委办公室·保密办公室
- 党委组织部
- 党校
- 党委宣传部
- 党委统战部
- 纪委（监察专员办公室合署）
- 离退休党工委·离退休办公室
- 研究生工作部
- 学生工作部
- 团委
- 工会
- 武装部
行政机构
- 校长办公室
- 人事处
- 科学技术处·国防军工科研处
- 科技家当处
- 社会科学处
- 教务处（藕舫学院）
- 实验室与设备管理处
- 财务处
- 总务处
- 国际合作与交流处·港澳台事务办公室
- 学生工作处
- 基建处
- 研究生院
- 学科建设处
- 审计处
- 发展规划处
- 校友工作办公室
- 守卫处
- 国际教育学院
- WMO区域培训中心
- 教师发展与教学评估中心
教学单位
- 大气科学学院
- 应用气象学院
- 大气物理学院
- 地舆科学学院
- 遥感与测绘工程学院
- 水文与水资源工程学院
- 海洋科学学院
- 环境科学与工程学院
- 自动化学院
- 电子与信息工程学院
- 计算机与软件学院
- 数学与统计学院
- 物理与光电工程学院
- 法政学院
- 马克思主义学院
- 管理工程学院
- 商学院
- 文学院
- 传媒与艺术学院
- 教师教育学院
- 化学与资料学院
- 大学体育部
- 继续教育学院
- 应用技术学院
- 人工智能学院
- 雷丁学院
- 长望学院
- 滨江学院
直属部分
- 网络信息中心
- 高等教育研究所
- 期刊部
- 图书馆
- 档案馆
- 校史馆
- 资产经营管理有限责任公司
- 后勤服务总公司
其他部分
- 气象灾害预报预警与评估协同立异中心
- 气象灾害教育部重点实验室
- 江苏省农业气象重点实验室
- 中国气象局气溶胶与云降水重点开放实验室
- 大气与环境实验教学中心
- 大气科学与气象信息虚拟仿真实验教学中心
- 大气科学实验教学中心·气象台
- 生态气象环境研究中心
- 江苏省大气环境监测与污染控制高技术研究重点实验室
- 江苏省气象探测与信息处理重点实验室
- 江苏省气象传感网技术工程中心
- 地球系统模拟中心
- 大气环境与装备技术协同立异中心
- 江苏省环境净化资料工程技术研究中心
- 江苏省大数据分析技术重点实验室
- 江苏省气象能源利用与控制工程技术研究中心
- 技术转移中心
- 太平洋台风研究中心

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